A Secretaria Especial de Administração (SA) é composta pelas seguintes subunidades: Gabinete (GAB), Divisão de Apoio Administrativo (DAA), Coordenação-Geral de Governança (CGGOV), Divisão de Segurança da Informação (DSI), Coordenação-Geral de Relações Públicas (Corep), Diretoria de Planejamento Orçamento Finanças e Contabilidade (Dirof), Serviço de Viagens Presidenciais (SVPRE), Serviço de Apoio e Acompanhamento (SVAAC), Coordenação-Geral de Planejamento Orçamento e Finanças (Copla), Divisão de Programação Financeira (DPOF), Coordenação de Planejamento e Orçamento (CPO), Divisão de Acompanhamento de Planejamento e Orçamento (Dapo), Divisão de Planejamento e Orçamento (DPO), Divisão de Monitoramento (DIM), Coordenação-Geral de Execução Orçamentária e Financeira (Cofin), Coordenação de Pagamento (Copag), Divisão de Conformidade (Dicon), Divisão de Passagens e Diárias (Dipad), Coordenação de Empenho (Coemp), Coordenação-Geral de Contabilidade e Custos (CGCONT), Coordenação de Contabilidade e Custos (CCON), Divisão de Contabilidade (DCONT), Diretoria de Gestão de Pessoas (Digep), Coordenação de Saúde (Cosau), Divisão de Promoção da Saúde (Disau), Divisão de Serviços Integrados em Saúde (Disis), Coordenação-Geral de Desenvolvimento de Pessoas (Codep), Divisão de Biblioteca e Acervo Digital (Dibib), Coordenação de Ações de Desenvolvimento de Pessoas (Coade), Divisão de Apoio a Ações de Desenvolvimento e Estágios (Diade), Coordenação de Estudos e Projetos em Gestão de Pessoas (Cepro), Divisão de Pesquisas em Gestão de Pessoas e Bem-Estar no Trabalho (Dipes), Divisão de Projetos em Gestão de Pessoas (Dipro), Coordenação-Geral de Gestão de Informações Funcionais (Cogif), Coordenação de Legislação de Pessoal (Coleg), Divisão de Direitos, Vantagens e Benefícios (DIDVB), Divisão de Pagamento (Dipag), Divisão de Cadastro (Dicad), Divisão de Atendimento ao Servidor (Diats), Diretoria de Recursos Logísticos (Dilog), Divisão de Desenvolvimento Institucional (Dides), Coordenação de Apoio Logístico às Residências Oficiais (Coaro), Coordenação de Documentação (Codoc), Coordenação de Planejamento Logístico (Coplog), Coordenação-Geral de Engenharia (Coeng), Coordenação de Projetos de Arquitetura e Engenharia (Copae), Coordenação de Engenharia e Manutenção (Coman), Coordenação-Geral de Licitação e Contrato (Colic), Coordenação de Licitações (Colit), Coordenação de Contratos (Contr), Coordenação de Contratação Direta (Codir), Coordenação-Geral de Transporte (Cotran), Coordenação de Locomoção (Coloc), Coordenação-Geral de Administração Geral (Coage), Coordenação de Serviços Gerais (Coseg), Divisão de Atividades Auxiliares (Diaux), Coordenação de Subsistência (Cosub), Divisão de Administração de Restaurantes (Diare), Coordenação de Material e Patrimônio (Comap), Divisão de Material (Dimat) e Divisão de Patrimônio (Dipat).